En 937, il existait déjà une église romane sur ce point culminant de Mariakerke. Dans la seconde moitié du 13e siècle, cette église de Notre-Dame de la Nativité fut totalement rénovée dans un style gothique scaldien.
La restauration de l’église en style néo-gothique débuta en 1870 sous la supervision de Jean-Baptiste Bethune, pionnier du style néo-gothique en Flandre. Durant la période de 1887 à 1892, l’église fut entièrement restaurée et agrandie selon un plan de l’architecte-restaurateur gantois Auguste Van Assche. La décoration intérieure et le mobilier fixe furent choisis en collaboration avec Jean-Baptiste Bethune.
L’église et ses alentours avec le cimetière et la galerie des évêques qui datent de 1873 (d’après Jean-Baptiste Bethune) constituent un endroit unique à Gand.